(1)「パソコンの仕組みからの転送」
　　　-->　意味がわかりません。Windows　の　DOS　コマンド・プロンプトのことですか　?
　　　　　　　それとも他の意味であればアプリの名前をお教えください。

(2)　AS400のﾗｲﾌﾞﾗﾘｰです。FTPでデータを授受するﾗｲﾌﾞﾗﾘｰを用意しています。
　　-->　Ftpのアップロード先がライブラリー・システムのファイルであれば
　　　　　　　後続の回答の「CPYFRMIMPFで　MSGW　のエラーとなる」との回答と矛盾しています。
　　　　　　　アップロード先が　ライブラリー・システムのファイルであれば
　　　　CPYFRMIMPF　を使う必要はありませんから。

(3)　おそらくですが無変換です。
　　-->　これもアップロード先がライブラリー・システムのファイルであれば
　　　　ASCII/EBCDIC　変換が必要であるはずなので意味不明です。
　　　　　　　「おそらくですが」も意味不明
　　　　　　　IFS　に対してアップロードしているのではないでしょうか　?

(4)AS400でCPYFRMIMPFが実行されると異常終了（MSGW）になります。
　--->　これも意味不明です。CPYFRMIMPF　で　MSGW　になったからといって
　　　　　　　なぜ　"　の欠落が原因であると判断されたのでしょうか　?
　　　　　　　IFS　またはライブラリー・システムのファイルのダンプを確認されたのでしょうか　?

　　　　　　　またせっかく　MSGW　のエラーが発生しているのであれば
　　　　　　　そのエラー・メッセージは何でしょうか　?
　　　　　　　それがエラーの原因でありエラー・メッセージはまさにその原因を
　　　　　　　教えてくれているはずです。
　　　　エラー・メッセージの内容は何となっていますか　?