良い解決方法が無いので面倒ですが次の運用で対応する事にしました。

1.　WEBからMXLファイルをＰＣの任意のフォルダーにダウンロードします。
2.　ＰＣ上でEXCEL2007を起動し、データタブ?「その他データソース」をクリック
3.　プルダウンリストの「XMLデータインポート」して
4.　終了時にCSV形式で保存する。
5.　このCSV形式ファイルをエミュレータのデータ転送でAS400に取り込む
6.　後はCSV形式ファイルをAS400内でCPYFRMIMPFコマンドでＤＢに取り込む

ちょっと手間ですが、仕方ないですね。
もっと良い方法があればご教示お願い致します。