良くないと思います。

ロー・エンド・モデルの　IBM　i　であれば昔は　QBASE配下一本で
動作していましたが，通常は　QINTER,　QBATCH,　QSPL　に
分割して動作させることが正しい運用です。

QINTERと　QBATCH,　QGPL　はご指摘のように各々、実行優先度も
異なりますが重要なのは　QBATCH　のジョブ記述が以前はどのように
なっていたかで　QBASE　に変更すると運用動作が変わってくる可能性が
あります。

これはQBATCHでは同時に実行できるジョブが一個ずつと限定されて
いる場合が多く、逆にそれを利用して月次バッチ業務が組まれている
可能性もあります。

QBASE　で全部を運用するのはあくまでロー・エンド・モデルや
エントリー・モデルの　IBM　i　用です。
今ではほとんどの　IBM　i　ユーザーは　QINTER　で動作されているはずですので
至急、変更されるべきであると思います。
i5/OSを導入した特約店フィールドSE　のミスであると思います。
その特約店に変更を依頼してください。