結論でいえばTCP/IP越しでのファイルロックを保持しないようなSQLスクリプ
トはないですね。
QZDASOINITについては下記参照のこと。
https://www.ibm.com/support/knowledgecenter/ja/ssw_i5_54/rzaii/rzaiiodbc25.htm

ファイルクリアが失敗というのはCLRPFMがこけたってことですよね。
私も経験あります。結局、RPGでDELETEという代価案にしました。