>　AS/400と5250とのIP接続で現場のﾌｫｰｸﾘﾌﾄの端末を乗せて使用しているのですが、
>　PCOMMの前ﾊﾞｰｼﾞｮﾝ(3270+5250のV6.01)では接続が切れて再接続してもﾘﾝｸが確立してｻｲﾝｵﾝ画面が
>　表示されるのですが、
>　新ﾊﾞｰｼﾞｮﾝ(5250のV6.16)では、ｻｲﾝｵﾝ画面にならず真っ黒の画面のままでAS/400のWRKACTJOBか
>　ら一度終了させてから再接続しています。
>　
>　何か設定があるのでしょうか？
>　ちなみにｾｯｼｮﾝﾊﾟﾗﾒｰﾀｰのﾜｰｸｽﾃｰｼｮﾝIDは前ﾊﾞｰｼﾞｮﾝも新ﾊﾞｰｼﾞｮﾝも入力されています。
>　
>　解られる方、教えてください。
>　お願いします。


状況がよく見えないのですが、新バージョン（PCOMM　V6.0.16）だと
一回途切れても自動再接続されないということでしょうか。
その場合、IP設定画面の「自動再接続」にチェックが入っていないだけではないでしょうか？

ソフトのバージョンの違いでAS上のジョブの残り方が異なるということはありえません。

もし、どう切り分けてもソフトのせいで異なるというのなら
そのPCOMMおかしくなってしまっているかもしれません。
Windows7をサポートしないPCOMMを入れてうまくいかなくなり、
それを削除→新しいPCOMMを入れるという流れで意味不明なバグに見舞われた例をいくつか見ました。